MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_015574	CTG	2	6	2532544	2532549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988630
40502	NC_015574	ACA	2	6	2532572	2532577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988630
40503	NC_015574	CCT	2	6	2532699	2532704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988630
40504	NC_015574	GAG	2	6	2532726	2532731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988630
40505	NC_015574	TGCAAT	2	12	2532745	2532756	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333988630
40506	NC_015574	AT	3	6	2532773	2532778	50 %	50 %	0 %	0 %	333988630
40507	NC_015574	ATAC	2	8	2532830	2532837	50 %	25 %	0 %	25 %	333988630
40508	NC_015574	AT	3	6	2532906	2532911	50 %	50 %	0 %	0 %	333988630
40509	NC_015574	CTC	2	6	2532957	2532962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988630
40510	NC_015574	ACG	2	6	2532977	2532982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988630
40511	NC_015574	TGATT	2	10	2533003	2533012	20 %	60 %	20 %	0 %	333988630
40512	NC_015574	TTG	2	6	2533348	2533353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988631
40513	NC_015574	AAT	2	6	2533418	2533423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333988631
40514	NC_015574	AATAG	2	10	2533515	2533524	60 %	20 %	20 %	0 %	333988631
40515	NC_015574	AAG	3	9	2533582	2533590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988631
40516	NC_015574	CAA	2	6	2533609	2533614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988631
40517	NC_015574	AGC	2	6	2533619	2533624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988631
40518	NC_015574	ACA	2	6	2533708	2533713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988631
40519	NC_015574	ATG	2	6	2533717	2533722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988631
40520	NC_015574	TGT	2	6	2533754	2533759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988631
40521	NC_015574	GGT	2	6	2533782	2533787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988631
40522	NC_015574	ATA	2	6	2533854	2533859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333988631
40523	NC_015574	ACA	2	6	2533861	2533866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988631
40524	NC_015574	GGT	2	6	2533886	2533891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988631
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40526	NC_015574	TTG	2	6	2533906	2533911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988631
40527	NC_015574	GAA	2	6	2533914	2533919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988631
40528	NC_015574	TTG	2	6	2533936	2533941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988631
40529	NC_015574	CTG	2	6	2533966	2533971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988631
40530	NC_015574	TTG	2	6	2534263	2534268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988631
40531	NC_015574	CTGT	2	8	2534329	2534336	0 %	50 %	25 %	25 %	333988631
40532	NC_015574	AGC	2	6	2534372	2534377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988631
40533	NC_015574	ATG	2	6	2534413	2534418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988631
40534	NC_015574	TAC	2	6	2534433	2534438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988631
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40536	NC_015574	TCA	2	6	2534478	2534483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988631
40537	NC_015574	TTG	2	6	2534497	2534502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988631
40538	NC_015574	AGCAGA	2	12	2534519	2534530	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333988631
40539	NC_015574	ACC	2	6	2534575	2534580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988631
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40542	NC_015574	AT	3	6	2535090	2535095	50 %	50 %	0 %	0 %	333988632
40543	NC_015574	A	6	6	2535125	2535130	100 %	0 %	0 %	0 %	333988632
40544	NC_015574	CAA	2	6	2535192	2535197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333988632
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40546	NC_015574	AAT	2	6	2535289	2535294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333988632
40547	NC_015574	TGA	2	6	2535336	2535341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988632
40548	NC_015574	ATG	3	9	2535357	2535365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988632
40549	NC_015574	TCT	2	6	2535448	2535453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988632
40550	NC_015574	GTAC	2	8	2535474	2535481	25 %	25 %	25 %	25 %	333988632
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40552	NC_015574	CTT	2	6	2535533	2535538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988632
40553	NC_015574	TTG	2	6	2535549	2535554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988632
40554	NC_015574	CTG	2	6	2535567	2535572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988632
40555	NC_015574	ACCAG	2	10	2535592	2535601	40 %	0 %	20 %	40 %	333988632
40556	NC_015574	TGA	2	6	2535727	2535732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988632
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40558	NC_015574	TGA	2	6	2535859	2535864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988632
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40589	NC_015574	T	6	6	2538576	2538581	0 %	100 %	0 %	0 %	333988634
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40599	NC_015574	ATCT	2	8	2538897	2538904	25 %	50 %	0 %	25 %	333988635
40600	NC_015574	ATG	2	6	2538907	2538912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988635
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.